Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms