Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME1P15531 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME1P15531 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME1P15531 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME1P15531 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME1P15531 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME1P15531 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME1P15531 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME1P15531 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME1P15531 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME1P15531 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME1P15531 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME1P15531 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NME1P15531 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms