Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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