Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPIND1P05546 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SERPIND1P05546 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms