Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF14O43557 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms