Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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