Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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H3F3CQ6NXT2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3CQ6NXT2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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