Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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