Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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