Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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