Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms