Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms