Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL8P80075 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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CCL8P80075 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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