Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms