Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms