Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms