Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DMDP11532 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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