Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms