Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms