Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms