Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TMEM27Q9HBJ8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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TMEM27Q9HBJ8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TMEM27Q9HBJ8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TMEM27Q9HBJ8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TMEM27Q9HBJ8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TMEM27Q9HBJ8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TMEM27Q9HBJ8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TMEM27Q9HBJ8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TMEM27Q9HBJ8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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