Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms