Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms