Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF550Q7Z398 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms