Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms