Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms