Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms