Protein–RNA interactions for Protein: Q53H64

LINC00483, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00483, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00483Q53H64 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00483Q53H64 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms