Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms