Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms