Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms