Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms