Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms