Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms