Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2FP61218 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms