Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms