Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHI3L1P36222 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHI3L1P36222 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms