Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VCLP18206 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VCLP18206 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VCLP18206 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms