Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms