Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOP08100 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOP08100 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOP08100 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOP08100 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms