Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC7A4O43246 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms