Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN34H7C241 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms