Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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GGTLC3B5MD39 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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GGTLC3B5MD39 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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GGTLC3B5MD39 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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GGTLC3B5MD39 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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GGTLC3B5MD39 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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GGTLC3B5MD39 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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GGTLC3B5MD39 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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GGTLC3B5MD39 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GGTLC3B5MD39 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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