Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD54BQ9Y620 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms