Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP25Q9UHP3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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