Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GIN1Q9NXP7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GIN1Q9NXP7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GIN1Q9NXP7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GIN1Q9NXP7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GIN1Q9NXP7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GIN1Q9NXP7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GIN1Q9NXP7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GIN1Q9NXP7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GIN1Q9NXP7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GIN1Q9NXP7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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