Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD1Q8NHV4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms