Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms