Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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