Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms